该调查是由美国总统乔·拜登于5月26日下令进行的。
而美国国家情报总监艾薇尔·海恩斯曾一开始就警告称，美国总统拜登当初下令对COVID-19病毒起源进行90天调查，很可能是无法产生结论的。
拜登于8月24日收到关于该机密调查的报告，并于27日公布了非机密版本，但调查没有产生关于病毒起源的确定结论。情报机构在此次疫情的起因是实验室事故还是人类与受感染动物的接触这一问题上存在分歧。
唯一有力的结论是，冠状病毒不是作为生物武器所人为开发出来的。大多数机构认为，它不太可能是转基因的。在一份新闻声明中，情报界表示，他们打算在不久的将来公布更多调查细节。
病毒学家罗伯特·加里(Robert Garry)表示，他和其他研究人员对情报界没有解决COVID-19起源之谜并不感到惊讶，因为对疫情起源的调查往往很复杂。
一些研究人员对这次科学调查表示欢迎。华盛顿特区战略与国际研究中心(Center for Strategic and International Studies)全球卫生政策主任斯蒂芬·莫里森(Stephen Morrison)表示：“我很高兴看到我们现在就这个问题进行了更细致入微的讨论。”
同时，研究人员也希望情报界能披露更多有关其调查过程的信息，并渴望听到由世界卫生组织(WHO)牵头或独立于该机构的进一步调查。
作为本次病毒溯源研究的一部分，美国联邦调查局(FBI)和中央情报局(CIA)的特工上个月还专门飞到路易斯安那州新奥尔良市，与病毒学家罗伯特·加里(Robert Garry)讨论COVID-19的起源。加里表示，这些人学识渊博，拥有分子生物学博士学位，而且也详细阅读了所有的论文，因此值得信赖。
此次访问是美国情报部门对冠状病毒SARS-CoV-2的来源进行90天调查的一部分。其实和许多研究人员一样，加里并不知道机密调查将采取什么策略，但他认为科学的方法至关重要。这些特工和他谈了关于冠状病毒进化的研究，还包括他自己的研究。
加州斯坦福大学的微生物学家大卫·雷尔曼(David Relman)表示，这是一个非常复杂的问题，没人认为这个问题会在夏天之前解决。
公开报告还显示，国家情报委员会和4个情报团体倾向于由动物自然传播给人导致感染的新冠病毒。
另一个小组倾向于从实验室事故中泄漏病毒的原因，另外三个小组尚未决定。
拜登谴责中国不配合调查
中国谴责美国溯源问题政治化
8月27日公开报告发布后，拜登总统发表声明称，美国将继续追查COVID-19的源头，并继续谴责中国缺乏合作，敦促中国官员全力配合世卫组织的第二阶段调查。
此前，中国拒绝了世卫新冠溯源第二阶段调查计划。7月22日，中国国家卫生健康委副主任曾益新称，世卫组织第二阶段计划将“中国违反实验室规程造成病毒泄露”作为研究重点之一，这透露出计划“对常识的不尊重和科学的傲慢态度”。
“我们是不可能接受这样一个溯源计划的，”他表示。“我们反对将溯源工作政治化”。
“溯源政治化”，同样也是中方坚决反对美国情报机构溯源调查的重要原因。
北京时间8月29日，中国外交部副部长马朝旭就美国情报部门发布溯源调查报告发表谈话，他认为美国情报部门炮制了所谓的溯源问题调查报告，其中运用了虚假信息，毫无科学性和可信度。而且美方还对中国进行污蔑攻击。
部长表示，“我们多次重申，新冠病毒溯源是一个复杂的科学问题，应该由全球科学家合作开展研究。但美国罔顾科学和事实，执迷于政治操弄和情报溯源。他们拿不出任何真凭实据，却一再编造谎言，对中国进行抹黑指责。他们的目的就是借溯源问题向中国“甩锅”推责，散播政治病毒。而且美国动用情报部门搞溯源，本身就是将溯源问题政治化的铁证。”
